Bir bilimsel deney, Mewtwo'nun bir klonunun yaratılmasına yol açtıktan sonra, o dünyayı yok etme amacıyla yola çıkar. Ash ve arkadaşları ise Mewtwo'nun kötü planlarını engellemeye karar verirler.
Hikaye, Ash Ketchum'un maceraları etrafında dönen uzun soluklu bir animasyon serisi olan Pokémon'dan gelmektedir. Ash, Pokémon yarışmalarında en iyisi olmayı, Pokémon eğitmeni olmayı ve bir Pokémon ustası olmayı hedeflemektedir. Yolda Ash'e, sadık Pokémon arkadaşları, Pikachu, Bulbasaur, Charizard ve daha birçok sevimli yaratık eşlik etmektedir.
Ancak, bu seferki macera biraz farklıdır çünkü Mewtwo'nun ortaya çıkmasıyla dünya tehlike altındadır. Mewtwo, insanların ve Pokémonların güçlerini kontrol edebilen bir klon olduğundan, güçlü bir düşman olarak ortaya çıkar. Kendi varoluşunu anlamak için dünyayı yok etme niyetindedir.
Ash ve arkadaşları, Mewtwo'nun kötü niyetli planlarını engellemek için bir araya gelirler. Ancak, bu görev kolay olmayacaktır. Mewtwo'nun güçleri ve zekası, onu sıradan bir düşmandan daha tehlikeli kılar. Ash ve arkadaşları, birlikte çalışarak, Pokémon savaş yeteneklerini kullanarak ve dostluklarını güçlendirerek başarıya ulaşmaya çalışırlar.
Bu epik savaş, Ash ve arkadaşlarının cesaret, kararlılık ve dayanıklılıkla dolu bir yolculuğuna dönüşür. Onlar için bu sadece bir Pokémon savaşı değil, aynı zamanda dünyayı kurtarma mücadelesidir. Ash, arkadaşlarına rehberlik eder ve onlara cesaret verirken, eğitimli Pokémonları ise güçlü saldırılarla Mewtwo'ya karşı savaşırlar.
Sonunda, Ash ve arkadaşları, Mewtwo'yu durdurmayı başarır ve dünyayı yok etme niyetinden vazgeçirirler. Bu zafer, Ash ve arkadaşlarının birlikte çalışma becerilerini ve sebatlarını gösterir. Bağlılık, dostluk ve cesaretle dolu bu hikaye, izleyicilere heyecan ve ilham verir.
Mewtwo'nun kötü planlarını engelleme görevi tamamlandığında, Ash ve arkadaşları, daha birçok maceraya atılmaya hazır olurlar. Pokémon dünyasında yeni zorluklar, keşifler ve dostluklar bekler. Ash, Pokémon eğitmeni olma yolunda ilerlemeye devam ederken, yeni hedeflerini ve hayallerini takip ederek büyümeye devam eder. Ve böylece, Pokémon serisi, seyircilere sınırsız bir macera ve eğlence sunmaya devam eder.
